これは素晴らしい。
SQLiteのJDBCライブラリを綺麗にまとめてくれてるサイトがありました。

こちらのダウンロードから。

V042ってやつを落としてみた。
sqlite-jdbc-v042.jar

あとは、Eclipseにて、外部Jarにてこれを参照させるだけ。

うお〜、JavaからSQLiteに書き込めたぁ〜。